Карта Клинцовского района

До 27 февраля 1802 года территория, занимаемая нынешним Клинцовским районом, входила в Стародубский полк Малороссийской губернии.

С 27 февраля 1802 года эта территория в трёх уездах Черниговской губернии: Суражском, Новозыбковском и Стародубском.

В 1918 году по Брестскому договору район находился в Черниговской губернии Украинской народной республики.

В конце 1918 года территория района вместе с Черниговской губернией включена в состав РСФСР.

С 11 июля 1919 года в составе Гомельской губернии.

В декабре 1926 года Гомельская губерния была упразднена — Клинцовский, Новозыбковский и Стародубский уезды отошли к Брянской губернии.

14 января 1929 года образован Клинцовский район в составе Клинцовского округа Западной области.

С 19 октября 1937 года район в составе Орловской области.

5 июля 1944 года Указом Президиума Верховного Совета СССР была образована Брянская область, в состав которой, наряду с другими, был включён и Клинцовский район.

В 1985 году из состава Клинцовского и Красногорского районов был выделен Гордеевский район, в результате, Клинцовский район несколько уменьшился, до современных размеров.